הגאון איש מצליח נהג לומר הקדושה בלחש עם החזן, וכעדות מו"ר בריה הגאון הנאמ"ן בקובץ ויען שמואל חלק ג' (עמוד ש"כ).
ואף אחד לא אמר בשם רבינו האר"י ז"ל לומר כל הקדושה עם החזן בקול רם, אלא לומר הקדושה בלחש עם החזן (מלבד תיבות נקדישך ונעריצך, ומה שעונים קק"ק וכו'). אם כי לאומרים הכל בקול רם יש להם על מה שיסמוכו. עיין בשו"ת יביע אומר חלק ז' (אורח חיים סימן י"ד אות א').